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X線和CT檢查均具有輻射，而磁共振檢查無輻射。X片主要用于消化道、泌尿道、乳腺以及骨骼的檢查，對神經(jīng)系統(tǒng)、頭顱的檢查效果不佳。CT適用于全身檢查，尤其對肺癌篩查效果較好，磁共振檢查也適用于全身檢查。

CT可用于顱腦的檢查，可看到腦室結(jié)構(gòu)，對腦實質(zhì)顯示不清楚。磁共振圖像會清楚的分出黑色、灰色、淺灰色、深灰色，對腦實質(zhì)結(jié)構(gòu)層次顯示比CT更清楚?？傊?，CT、X線和磁共振優(yōu)勢不同，磁共振更適合于檢查神經(jīng)系統(tǒng)，CT更適合檢查肺部。