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亞急性甲狀腺炎分為亞急性肉芽腫性甲狀腺炎，以及亞急性淋巴細胞性甲狀腺炎。亞急性肉芽腫性甲狀腺炎起病前經(jīng)常有病毒感染病史，典型病程包括甲亢期、甲減期和恢復期三個階段，起病相對急驟，前期呈甲亢相關的癥狀，如發(fā)熱、畏寒、乏力等癥狀，此后在數(shù)周到數(shù)月內的甲狀腺功能恢復正常的病人，癥狀逐漸消失。
亞急性淋巴細胞性甲狀腺炎發(fā)病與自身免疫因素有關，患者甲狀腺組織內有大量淋巴細胞浸潤，同時血漿中有甲狀腺過氧化物酶抗體，患者臨床癥狀包括甲亢相關癥狀，在起病數(shù)月內逐漸恢復正常，但有一部分患者會轉歸成永久性甲減。