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流行性乙型腦炎的傳播途徑主要是通過(guò)蚊蟲(chóng)叮咬來(lái)傳播，能傳播流行性乙型腦炎的蚊蟲(chóng)很多，現(xiàn)已被證實(shí)為庫(kù)蚊、伊蚊、按蚊的某些種類(lèi)。國(guó)內(nèi)的主要傳播媒介是三帶喙庫(kù)蚊，被感染的候鳥(niǎo)、蝙蝠等也可以是乙型腦炎病毒的越冬宿主。人群普遍易感，流行的季節(jié)80%-90%發(fā)燒于7月、8月、9月。
蚊蟲(chóng)叮咬后病毒進(jìn)入體內(nèi)，被單核巨噬細(xì)胞系統(tǒng)繁殖，隨之進(jìn)入血流。病毒感染后是否發(fā)病，取決于病毒感染的數(shù)量和毒力，更取決于人體的免疫力。當(dāng)人免疫力比較強(qiáng)的時(shí)候，僅形成短暫的病毒血癥，而不侵入中樞神經(jīng)系統(tǒng)，臨床表現(xiàn)為隱性感染或輕型病例。如果人體免疫力差，會(huì)突破血-腦屏障而侵入中樞神經(jīng)系統(tǒng)，并繁殖，由病毒對(duì)中樞神經(jīng)系統(tǒng)的直接作用和免疫性的損傷，導(dǎo)致腦炎的病變。因此，為了預(yù)防流行性乙型腦炎，主要是要加強(qiáng)滅蚊和防蚊，以及對(duì)易感人群進(jìn)行疫苗接種。