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亞急性感染性心內(nèi)膜炎病因最常見為草綠色鏈球菌(80%)，系正常咽腔菌叢，僅在用力刷牙、鑲牙、特別是在拔牙后引起菌血癥而發(fā)病。其他如糞鏈球菌也可引起嚴重心內(nèi)膜炎，見于胃腸道或泌尿生殖道感染，常在泌尿生殖道器械檢查或分娩之后細菌進入血流而致病，引起心內(nèi)膜炎的霉菌有組織胞漿菌屬和各種念珠菌屬，后者常見于糖尿病病人、心臟瓣膜置換病人及皮下或靜脈注射毒品成癮的病人。厭氧菌感染并非常見，但若有贅生物形成，則可為厭氧菌滯留在灌注不良的贅疣內(nèi)提供機會。由金黃色葡萄球菌、白色葡萄球菌、立克次體、產(chǎn)氣桿菌引起者均有報道。