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慢性腸炎的鑒別診斷主要需要和腸結(jié)核、功能性腸炎、潰瘍性結(jié)腸炎以及胃腸功能紊亂等進(jìn)行相關(guān)的鑒別，一般情況下建議患者做腸鏡可能相對(duì)比較直接、有效的判斷，必要時(shí)取病理活檢，可以明確相關(guān)的診斷。
而腸結(jié)核的診斷還可以通過(guò)痰查痰抗酸桿菌，抽血化驗(yàn)血沉等進(jìn)一步進(jìn)行相關(guān)的鑒別。潰瘍性結(jié)腸炎也可以通過(guò)實(shí)驗(yàn)性的藥物治療，比如通過(guò)柳氮磺胺嘧啶等對(duì)癥處理，如果效果明顯可以基本判斷是潰瘍性結(jié)腸炎。
還有一部分如果是細(xì)菌性痢疾造成的慢性腸炎可以通過(guò)針對(duì)性的抗生素進(jìn)行治療，也可以試驗(yàn)室診斷，細(xì)菌性痢疾的疾病診斷。
如果是神經(jīng)官能癥一般是完善相關(guān)的檢查后，沒(méi)有發(fā)現(xiàn)明顯的器質(zhì)性病變，才考慮功能性疾病的診斷。