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肥胖的發(fā)病機制目前尚不明確，單純性肥胖與遺傳因素有關(guān)，具有明顯的遺傳背景。父母肥胖則子女發(fā)生肥胖的風(fēng)險增高5-8倍，少數(shù)家族性肥大與肥胖相關(guān)基因突變有關(guān)。
此外，環(huán)境因素在單純性肥胖發(fā)病中發(fā)揮重大作用，能量攝入和能量消耗的失衡導(dǎo)致肥胖的發(fā)生率日益升高。腸道菌群紊亂也是肥胖發(fā)病的主要機制，在腸道菌群中存在著有益菌和有害菌。有益菌減少、有害菌增多則會促進肥胖的發(fā)生。
內(nèi)分泌紊亂如胰島素、性激素和糖皮質(zhì)激素的平衡失調(diào)，也是肥胖發(fā)病的重要因素。